因为PET-CT检查癫痫时候所依靠的脑内病灶的代谢区域比较，一般来说癫痫病灶所在区域的代谢程度和正常区域的代谢程度是不同的，而PET-CT检查也正是基于这点，来定位癫痫病灶的位置的。
早在1978年一些国外的医疗研究者们就提出癫痫灶在发作间期的葡萄糖代谢降低，而自80年代Engel等报道应用FDG PET对癫痫定位诊断的方法以来，多数文献证实在发作间期FDG PET显像对癫痫灶的检出率约80%—90%。
PET-CT为什么能检查癫痫?在临床常见的患者中颞叶癫痫是目前药物难治性癫痫中开展手术最多，手术效果最好的一种，临床与电生理学研究证实，70% ~ 80%的原发性癫痫是颞叶癫痫，其常见的病理改变主要是以下几个方面：
选择性神经元丧失，位于癫痫灶内抑制性神经元数目的选择性减少;
神经元改变，癫痫灶内不仅有神经元数目减少，而且可观察到显的受累神经元细胞如GABA能抑制性细胞树突或树突棘的丧失;
另外星型胶质细胞增生及胶质化，胶质细胞增生使慢性病程或病程长者因大量胶质细胞增生而形成胶质疤痕。
这些病理学的是发作间期FDF PET表现为低代谢的主要原因。
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